L'Institut a obtenu des distinctions honorifiques d'encouragement à poursuivre les efforts entrepris et à élargir ses activités de promotion et de protection des droits de l'Homme :

1. - La première distinction est la médaille de la Mention spéciale du Prix des droits de l'Homme 1996 de la République française décernée par la Commission Nationale Consultative des Droits de l'Homme, fondée par le Professeur René Cassin. A cette occasion, l'Institut a reçu en décembre 1996, les félicitations de Monsieur Jacques CHIRAC, Président de la République française, pour les actions entreprises depuis sa création en 1993. Cet encouragement moral de haute portée est un soutien pour continuer l'action entreprise.

2. - A l'occasion de la célébration du 50 ème anniversaire de la Déclaration universelle des droits de l'homme, l'Organisation des Nations Unies pour l'éducation, la science et la culture (UNESCO) a demandé à l'Hôtel de la Monnaie de Paris de frapper une médaille commémorative au nom de l'UNESCO pour l'IDH. Pour l'UNESCO, cette médaille est une marque de reconnaissance pour la contribution remarquable de l'Institut à la promotion et la protection des droits de l'homme et l'encourage à poursuivre ses efforts méritoires en faveur des droits fondamentaux de l'être humain.

3. - La troisième distinction honorifique est la Mention d'honneur du Prix UNESCO 2002 de l'éducation aux droits de l'homme décernée à l'IDH lors de la treizième réunion du Jury international de l'UNESCO à Paris, les 28 et 29 octobre 2002.

Ces distinctions honorent le Bénin et l'IDH co-fondé par feu Mgr Isidore de Souza et le Professeur Maurice Glèlè Ahanhanzo en vue de « former des citoyens conscients de leurs droits et devoirs et capables de prendre en main leur destinée, et partant leur développement » et encouragent l'Institut à poursuivre les efforts entrepris et à élargir ses activités à la base.